Peyniraltı suyu proteinleri, bazı kanser türlerine karşı da koruyucu etkiye sahiptir. Peyniraltı suyu protein fraksiyonları aktivite göstererek kolon kanserinin gelişimi önlerler. Standart tümör oluşturan maddelerle beslenen farelerde tümör belirtisi gösteren hücre sayılarının ölçülmesiyle bu tespit edilmiştir. Laktoferrin ve ß-laktoglobulin, bu hücrelerinin azalmasına sebep olmaktadır .